Для запуска файлов есть функция Shell. Синтаксис:
Shell "[cmd /X /C] start Путь к файлу", [фокус](не обязательно)

Пример:
Для винда 98(95,Me, Vista, W7):

Shell "start c:1.txt", vbHide

Для виндусов XP:

Shell "cmd /X /C start c:1.txt", vbHide

Программу то мы вызвали, но что делать, если ей надо передать рабочую папку? Что мы делаем в командной строке? Правильно, используем команду ChDir. В VB аналогом выполнения этой команды служит изменение переменной CurDir... Итак, пишем код:

Dim CurDirBackup As String 'Объявляем переменную для хранения настоящей рабочей папки
CurDirBackup = CurDir 'Сохраняем свою рабочую папку в переменную, для последующего восстановления
CurDir = "Путь к проге" 'Сюда пишем путь к нашей проге
Shell "Прога.exe" 'Запускаем нашу прогу
CurDir = CurDirBackup 'Восстанавливаем исконное значение переменной CurDir

Вот и все. При желании, переменную CurDirBackup можно очистить, присвоив ей значение Nothing.